종근당바이오 (063160)

종근당바이오는 2025년 매출이 1,601억원으로 전년 대비 6.8% 감소하며 외형적 위축을 보였고, 영업이익은 36.1억원으로 전년 대비 67.1% 급감했다. 특히 순이익이 -28.9억원으로 적자 전환된 점과 부채비율이 상승한 재무 구조를 고려할 때, 핵심 사업의 수익성 회복이 시급한 과제다.

• 2025년 매출은 1,601억원으로 전년 대비 6.8% 감소했다.
• 2025년 영업이익은 36.1억원으로 전년 대비 67.1% 급감했다.
• 2025년 순이익은 -28.9억원을 기록하며 다시 적자로 전환했다.
• 영업이익률은 -12.6%에서 6.4%, 2.3%로 개선세가 둔화되는 추세다.
• PBR 0.55배, PSR 0.44배로 밴드 하단에 위치해 있으나 수익성 부재가 반영된 수치다.

사업 구조

종근당바이오는 2001년 종근당으로부터 원료의약품 사업부문이 분할되어 설립된 발효·바이오 전문기업이다. 회사는 안산, 오송, 예산 등 3곳의 생산 거점을 기반으로 세계 40여 개국에 원료의약품(API), 프로바이오틱스, 보툴리눔톡신 제품을 공급하고 있다. 핵심 사업 영역은 크게 네 가지로 구분된다. 첫째, 항생제(Rifampicin, 세팔로스포린계 등), 당뇨병치료제(Acarbose), 면역억제제(Cyclosporin A, Tacrolimus) 등 고부가가치 원료의약품을 생산하는 API 사업이 전통적 주력 영역이다. 회사는 미국 FDA, 유럽 EMA 등 글로벌 규제기관 기준에 부합하는 cGMP 환경을 유지하며 고품질 제품을 공급하고 있다. 둘째, 50여 년간 축적된 발효 기술을 바탕으로 차별화된 기능성 프로바이오틱스 원료를 생산하는 프로바이오틱스 사업을 영위한다. 셋째와 넷째 영역은 발효·합성 기술을 공통 기반으로 하는 사업들로 구성된다. 현재 매출 규모는 2024년 1,718억원에서 2025년 1,601억원으로 소폭 감소했으며, 이는 글로벌 공급망 환경이나 제품별 수요 변화가 복합적으로 작용한 결과로 풀이된다. 특히 고난이도 합성·발효 기술력을 바탕으로 한 글로벌 품질 기준 충족 역량이 향후 외형 회복의 핵심 동력이 될 전망이다.

실적 분석

최근 3개년 실적은 외형 성장 정체와 수익성 악화가 뚜렷하게 나타난다. 2023년 매출 1,604억원, 영업손실 -202억원, 순손실 -242억원을 기록한 이후, 2024년에는 매출 1,718억원, 영업이익 110억원, 순이익 87.0억원을 기록하며 흑자 전환에 성공했다. 그러나 2025년 매출은 1,601억원으로 전년 대비 6.8% 감소했고, 영업이익은 36.1억원으로 전년 대비 67.1% 급감했다. 순이익은 -28.9억원을 기록하며 다시 적자로 돌아섰다. 분기별 흐름을 보면 2024Q4 매출 314억원, 영업이익 2.1억원에서 2025Q1 매출 425억원, 영업이익 20.9억원으로 성장했으나, 2025Q2 매출 412억원, 영업이익 28.8억원, 순이익 -4.8억원을 기록한 후 2025Q3 매출 341억원, 영업이익 -14.7억원, 순이익 -21.8억원을 기록하며 수익성이 꺾이는 양상을 보였다. 2025Q4 매출은 422억원, 영업이익은 1.1억원으로 회복세를 시도했으나 순이익은 -11.3억원을 기록했다. 영업이익률 추이는 -12.6%, 6.4%, 2.3%로 개선세가 둔화되며 수익 구조의 한계가 드러나고 있다.

전망

향후 실적은 매출 회복과 영업이익률 개선이 동시에 달성되는지가 관건이다. 2025년 매출이 전년 대비 6.8% 감소하고 영업이익이 67.1% 급감한 상황에서, 핵심 사업인 API 및 프로바이오틱스 부문의 글로벌 수요가 회복되어야 한다. 특히 2025Q3에 나타난 영업손실(-14.7억원)과 순손실(-21.8억원)의 원인이 일회성 비용인지, 혹은 구조적인 수익성 악화인지를 파악하는 것이 중요하다. 만약 구조적 문제라면 영업이익률 2.3% 수준을 상회하는 개선이 필요하다. 또한, 2025년 순손실 -28.9억원을 기록하며 재무적 부담이 가중된 만큼, 부채총계 1,728억원 대비 자본총계 1,270억원의 비율을 관리하며 재무 건전성을 확보하는 것이 필수적이다. 글로벌 규제기관의 cGMP 기준 준수 역량을 바탕으로 고부가가치 제품의 수출 비중을 확대할 수 있다면 외형과 수익성의 동반 회복이 가능할 것이다.

밸류에이션

종근당바이오는 현재 주가 12810원, 시가총액 703억원으로 거래되고 있다. 2025년 실적 기준 PER은 산출 불가(적자)이며, EPS도 null이다. PBR은 0.55배로 업종 내 PBR 밴드 하단(0.54)에 근접해 있으며, PSR은 0.44배로 하단(0.43)에 위치해 있다. ROE는 -2.3%로 마이너스이며, 주당순자산은 23156원이다. 현재의 낮은 PBR과 PSR은 수익성 부재와 재무적 부담을 반영한 결과로 해석된다. 2025년 매출이 전년 대비 감소하고 순이익이 적자로 돌아선 상황에서, 낮은 배수 자체가 저평가로 이어지기 위해서는 영업이익률의 뚜렷한 반등과 자본 구조의 개선이 선행되어야 한다.

강세 요인

약세 요인

리스크

종합 의견

종근당바이오는 발효 및 합성 기술력을 바탕으로 한 탄탄한 기술적 기반을 보유하고 있으나, 최근 실적은 외형 축소와 수익성 악화라는 과제에 직면해 있다. 2025년 매출이 전년 대비 6.8% 감소하고 영업이익이 67.1% 급감하며 순손실을 기록한 점은 현재의 사업 구조가 효율적인 수익을 창출하지 못하고 있음을 보여준다. 향후 판단의 핵심은 두 가지다. 첫째, 영업이익률 2.3% 수준을 극복하고 흑자 폭을 확대할 수 있는 고부가가치 제품의 매출 비중 확대 여부다. 둘째, 부채총계가 자본총계를 상회하는 재무 구조 속에서 순손실을 멈추고 자본을 확충할 수 있는 재무적 안정성 확보다. 낮은 PBR과 PSR은 현재의 수익성 부재를 반영하고 있으므로, 실질적인 실적 반등과 재무 건전성 개선이 확인될 때까지는 보수적인 관점에서의 확인이 필요하다. 본 리포트는 정보 제공을 목적으로 하며 특정 종목의 매매를 권유하지 않는다. 투자 판단과 그 책임은 투자자 본인에게 있다.

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